高新技術(shù)企業(yè)認(rèn)定專項(xiàng)審計(jì)的風(fēng)險(xiǎn)主要是稅務(wù)風(fēng)險(xiǎn)。在高新技術(shù)企業(yè)認(rèn)定時(shí)稅務(wù)機(jī)關(guān)實(shí)際上是不參與的，他們只是根據(jù)科技管理部門認(rèn)定的資料備案。但一旦認(rèn)定了就必然會(huì)有享受稅收優(yōu)惠的事實(shí)，如果事后因各種原因被發(fā)現(xiàn)是虛假的，那么稅務(wù)機(jī)關(guān)和科技管理部門很可能會(huì)把責(zé)任推到出具高新技術(shù)企業(yè)認(rèn)定專項(xiàng)審計(jì)報(bào)告的會(huì)計(jì)師事務(wù)所身上。
一、如何控制高新技術(shù)企業(yè)認(rèn)定專項(xiàng)審計(jì)的風(fēng)險(xiǎn)
我們應(yīng)當(dāng)運(yùn)用職業(yè)判斷，以質(zhì)疑的思維方式評(píng)價(jià)所獲取證據(jù)的有效性，確定專項(xiàng)審計(jì)時(shí)需要特別考慮的重大錯(cuò)報(bào)風(fēng)險(xiǎn)。如：
1.申報(bào)企業(yè)管理層存在為了申請(qǐng)高新技術(shù)企業(yè)資格以享受稅收優(yōu)惠政策的動(dòng)機(jī)，可能導(dǎo)致高新技術(shù)研究開發(fā)費(fèi)用支出與高新技術(shù)產(chǎn)品（服務(wù)）收入存在重大錯(cuò)報(bào)。
2.高新技術(shù)產(chǎn)品（服務(wù)）收入是否涉及重大的關(guān)聯(lián)方交易，使得高新技術(shù)產(chǎn)品收入作價(jià)不公允，以提高高新技術(shù)產(chǎn)品收入。
3.高新技術(shù)系統(tǒng)集成產(chǎn)品收入的確認(rèn)，是否可能存在較大的隨意性從而產(chǎn)生高新技術(shù)產(chǎn)品收入確認(rèn)的風(fēng)險(xiǎn)。
4.申報(bào)企業(yè)如何區(qū)分高新技術(shù)產(chǎn)品收入和企業(yè)的其他收入。
5.申報(bào)企業(yè)如何界定研發(fā)費(fèi)用支出和企業(yè)的其他費(fèi)用支出。
二、如何對(duì)研究開發(fā)費(fèi)用實(shí)施進(jìn)一步審計(jì)程序
我們從申報(bào)企業(yè)從立項(xiàng)和預(yù)算管理、人員管理、設(shè)備及材料管理、委托外部研究開發(fā)管理、結(jié)項(xiàng)管理等流程分析中識(shí)別研究開發(fā)費(fèi)用的關(guān)鍵控制點(diǎn)，對(duì)研究開發(fā)費(fèi)用實(shí)施進(jìn)一步審計(jì)程序。
對(duì)人員人工：重點(diǎn)檢查應(yīng)付工資、管理費(fèi)用明細(xì)賬，全年各月份工資表，全年個(gè)人所得稅申報(bào)表，勞動(dòng)合同、參加社會(huì)保險(xiǎn)資料，結(jié)合研發(fā)部門人員名單，確定研發(fā)人員的工資費(fèi)用是否真實(shí)，計(jì)算是否準(zhǔn)確。對(duì)受雇的科研人員累計(jì)實(shí)際工作時(shí)間要有在183天以上證據(jù)。對(duì)企業(yè)存在多個(gè)研發(fā)項(xiàng)目的，還要按實(shí)際參與的項(xiàng)目進(jìn)行歸集，若研發(fā)人員同時(shí)參與兩個(gè)或兩個(gè)以上項(xiàng)目應(yīng)按統(tǒng)計(jì)的工作量進(jìn)行分?jǐn)偅瑹o(wú)工作量統(tǒng)計(jì)的，則選擇當(dāng)期各項(xiàng)目直接投入占總投入比例進(jìn)行分?jǐn)偂?/p>
對(duì)直接投入：重點(diǎn)檢查管理費(fèi)用、原材料明細(xì)賬、原材料購(gòu)入、發(fā)出、結(jié)存明細(xì)表、相關(guān)費(fèi)用分配表等，確認(rèn)其結(jié)轉(zhuǎn)研發(fā)費(fèi)用的合理性及金額的準(zhǔn)確性。對(duì)于直接購(gòu)入的能源、材料則檢查購(gòu)入的發(fā)票、運(yùn)輸單據(jù)、入庫(kù)單、領(lǐng)料單等，確認(rèn)其真實(shí)性及與研發(fā)的項(xiàng)目相關(guān)性。對(duì)動(dòng)力費(fèi)用、共同使用的模具、樣品、樣機(jī)及一般測(cè)試手段購(gòu)置費(fèi)等按各種研發(fā)項(xiàng)目使用的工作量等方法計(jì)算后計(jì)入。
對(duì)折舊費(fèi)用與長(zhǎng)期待攤費(fèi)用：重點(diǎn)檢查固定資產(chǎn)明細(xì)賬、長(zhǎng)期待攤費(fèi)用明細(xì)賬，檢查被申報(bào)企業(yè)年度新增固定資產(chǎn)及長(zhǎng)期待攤費(fèi)用的發(fā)票、固定資產(chǎn)的申購(gòu)單、入庫(kù)單、驗(yàn)收單，實(shí)地查看該部分設(shè)備，確定其是否真實(shí)存在，是否用于研發(fā)。符合各項(xiàng)折舊、攤銷的準(zhǔn)確性。對(duì)購(gòu)入時(shí)已計(jì)入研發(fā)費(fèi)用的是否重復(fù)計(jì)提折舊。對(duì)屬于多個(gè)項(xiàng)目使用的，按各研發(fā)項(xiàng)目使用的工作量等方法計(jì)算后計(jì)入。
對(duì)設(shè)計(jì)費(fèi)用：重點(diǎn)檢查管理費(fèi)用明細(xì)賬—研發(fā)費(fèi)用明細(xì)科目，檢查涉及費(fèi)用支出的發(fā)票，付款申請(qǐng)審批單據(jù)，確認(rèn)其費(fèi)用發(fā)生的真實(shí)性及金額的準(zhǔn)確性。委外設(shè)計(jì)費(fèi)需查看合同、協(xié)議等。
對(duì)裝備調(diào)試費(fèi)：重點(diǎn)檢查是否為大規(guī)模批量化和商業(yè)化生產(chǎn)所進(jìn)行的常規(guī)性工裝準(zhǔn)備，以確定是否可以計(jì)入研究開發(fā)費(fèi)用。
對(duì)無(wú)形資產(chǎn)攤銷：重點(diǎn)檢查無(wú)形資產(chǎn)明細(xì)賬、管理費(fèi)用明細(xì)賬，檢查無(wú)形資產(chǎn)購(gòu)入發(fā)票、付款憑證、轉(zhuǎn)悠技術(shù)證書等資料，確認(rèn)其真實(shí)性及攤銷金額的準(zhǔn)確性。如屬于多個(gè)項(xiàng)目使用的，按各研發(fā)項(xiàng)目使用的工作量等方法計(jì)算后計(jì)入。
對(duì)委托外部研究開發(fā)費(fèi)用：重點(diǎn)檢查管理費(fèi)用明細(xì)賬、與委托外部研究開發(fā)費(fèi)用相關(guān)的明細(xì)賬，委托外部研究開發(fā)費(fèi)用的合同或協(xié)議，檢查發(fā)票、付款憑證，確認(rèn)其發(fā)生的真實(shí)性及金額計(jì)算的準(zhǔn)確性，是否關(guān)聯(lián)交易，關(guān)聯(lián)交易的發(fā)生金額應(yīng)按照獨(dú)立交易原則確定。關(guān)注是否按照委托外部研究開發(fā)費(fèi)用發(fā)生額的80%計(jì)入研發(fā)費(fèi)用總額。
對(duì)其他費(fèi)用：重點(diǎn)檢查管理費(fèi)用明細(xì)賬，費(fèi)用分?jǐn)偙恚_認(rèn)費(fèi)用支出與研發(fā)項(xiàng)目的相關(guān)性及費(fèi)用分?jǐn)偟暮侠硇?。關(guān)注其他費(fèi)用金額不高于研發(fā)費(fèi)用總額的10%。如屬于多個(gè)項(xiàng)目的，按各項(xiàng)目直接投入占總投入比例進(jìn)行分?jǐn)?，若費(fèi)用較小則直接計(jì)入某項(xiàng)目。
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